En el Gobierno de Samper establecieron la oficina del Alto Comisionado para los Derechos Humanos de las Naciones Unidas en Bogotá para supervisar la situación de los derechos humanos en Colombia y asistir al Gobierno, la sociedad civil y las organizaciones no gubernamentales en el ámbito de la protección de los derechos humanos. Almudena Marranza fue la primera Comisionada de Derechos Humanos que entró a los cuarteles, dictó cátedras de derechos humanos en las unidades militares, visitó los lugares en combate y acompañó los esfuerzos del Gobierno Samper por respetar los derechos humanos.